Peli sijoittuu Soleannan kauniiseen vedenalaiseen kaupunkiin. Sonicin ensimmäisessä seikkailussa ihmisten maailman hän tapaa kauniin prinsessan nimeltään Elise jonka kanssa he ystävystyvät nopeasti. Prinsessa kuitenkin kidnapataan ja tämän takana on tietenkin kukas muukaan kuin paha Dr.Eggman.

Palauttaakseen rauhan ja järjestyksen, on Sonicin päästävä läpi monista seikkailuista ja niiden tuomista haasteista joissa Sonic kohtaa niin ystäviä kuin vihollisiakin lopulta ollen vastakkain pahan tohtorin kanssa. Matkalla Sonic kohtaa mystisen hahmon nimeltä Silver jonka voimien edessä jopa Sonic on hätää kärsimässä.

• Seuraavan sukupolven grafiikat
• Paluu nopeatempoiseen peliin
• 15 vuoden historia - Ystäviä ja vihollisia vuosien varrelta
• Realistisen fysiikat jotka ovat luotu vauhdintuntua varten
• 2 erityyppistä kenttää - Kaupunki jossa Sonic voi tutkia paikkoja ja tehdä tehtäviä sekä toimintakentät joissa Sonicin räjähtävää nopeutta käytetään täysin hyödyksi