Seikkailijat huomaavat että Super Monkey Ball Adventure mahdollistaa isommat, paremmat ja hyödyllisemmät pallot. Uusia ominaisuuksia ovat mm. seinään takertuminen, ilmassa leijuminen ja näkymättömyys. Super Monkey Ball Adventure sisältää myös 50 uutta pulmaa ja 6 uutta "bilepeliä".

Aiai, Meemee, Gongon ja Baby toimivat pelaajan hahmoina seikkailussa Monkey Ball kuningaskuntien halki.