Jak- ja Ratchet-sarjojen uudistuessa pelillisesti, perinteisimmillä linjoilla pysyttelevä Sly 3 tuo mukanaan uuden ulottuvuuden. Pelin mukana tulee nimittäin perinteiset sinisellä ja punaisella linssillä varustetut 3D-lasit, jotka asianmukaisesti käsitellyllä kuvalla tuottavat kolmiulotteisen vaikutelman. Systeemi on siis sama, mikä on ehkä paremmin tuttu elokuvista.

Sly 3:n kehityksestä vastaava Sucker Punch ei aio tyytyä pelkkään 3D-vaikutelmaan, vaan luvassa on tehtäviä ja minipelejä, jotka on erityisesti suunniteltu 3D-laseja silmälläpitäen.