The Walking Deadin kolmoskaudella Clementine on taas sivuosassa, kuten ykköskaudella. Tällä kertaa pelataan Javin roolia. Javi seikkailee zombien miehittämässä Amerikassa veljen vaimon ja tämän lasten kanssa.

Joka jakso alkaa takaumalla, joko zombiepidemian alusta tai sitä ennen. Takauma on eräänlainen lämmittelykierros ennen varsinaista pelin alkua. Tsompipelin kolmannella kaudella tehdään tuttavuutta erinäköisiin yhteisöihin. Yhteisöt eivät ole onneksi niin läpimätiä, mikä kuuluu Walking Dead kliseisiin, vaan ovat enemmän harmaita.